内蒙古民航机场集团公司成立于2003年12月19日，其前身为内蒙古自治区民用航空管理局。2005年12月19日，首都机场集团公司正式托管内蒙古民航机场集团公司。目前，公司直接管理、经营呼和浩特机场、包头机场、巴彦淖尔机场、呼伦贝尔机场、赤峰玉龙机场、锡林浩特机场、通辽机场、乌兰浩特机场、乌海机场、阿尔山机场等区内9家民用机场，并委托经营管理二连浩特机场、阿尔山机场和根河机场。