自然界的一群微生物（主要是土壤细菌）利用外部无机化合物作为电子供体，靠化学暗反应用氧分子进行氧化获得能量，称为无机呼吸，进行这种呼吸的生物称为无机氧化生物。可作为无机呼吸底物的物质有NH4 和NO2-等还原态氮化合物，H2S、S（胶体状）、S2O32-、SO32-等硫化合物、铁化合物以及分子态氢。