查干湖国家级自然保护区位于吉林省西部地区，东经124°10'~124°32'，北纬45°10'~45°21'，跨大安、乾安和前郭三县（市），主体部分位于前郭县境内。保护区属于内陆湿地和水域生态系统类型，总面积为506.84平方公里，另设外围保护带面积为146.66平方公里。