鄞州区卫生局是主管本行政区域卫生工作的政府职能部门。下辖公立医疗卫生单位33家,其中有区级医疗卫生机构6家,社区卫生服务中心24家。2010年,全区平均人口期望寿命达到79.71岁,每千人口(按户籍人口计算)拥有床位4.78张、卫技人员8.2名、医生3.71名、护士2.63名,孕产妇死亡率为0,婴儿死亡率为3.96‰,自来水普及率达到100%。