1、《黄帝内经.素问》：小肠者，受盛之官，化物出焉，小肠分三段，十二指肠、空肠、回肠，十二指肠的起端连胃，回肠末端连盲肠，空肠位在中间。在十二指肠有胆管出口，当食入脂肪，胆囊收缩将储存的来自肝细胞分泌的胆汁从这个出口泌出，促进脂肪消化，也促进脂溶性维生素A、维生素D、维生素K的吸收。胰腺分泌的各种酶、酶原、胰岛素也通过胰腺管从这个出口排入十二指肠，消化吸收蛋白质、脂肪和糖。
2、小肠的作用就是进一步消化吸收来自胃初步消化过的食物。中医根据当时中央制度类比取象，封小肠为“受盛之官”，“化物出焉”，即司化物之职。除了消化吸收，还有将吸收所剩的糟粕排入大肠以排出体外的功能，此即"泌别清浊”。小肠吹收的水份从膀胱排出，此谓“下达膀胱”。"泌别其清浊宣通”为小肠的功能。
3、从消化、吸收、传化的功能看小肠，中西医大致相同。但从类比取象的角度，小肠与心（君主之官）相表里，关系密切。心是皇上，小肠相当宰相，在这里小肠除了消化吸收物质营养，还将吸收的所有精神信息进行“泌別清浊”，将对心有用的信息传交给心，再由心定夺并拟出"诏书"通过三焦（决渎之官）从水路发送全身各官。这就“主明则下安”，“主不明十二官危”的道理。
4、从病理角度，小肠功能失常会引起的常见疾病为小肠气（疝气），肠梗阻，十二指肠溃疡以及引起的肠出血，肠穿孔等。小便异常，中医也归小肠病，如尿频尿急尿痛属小肠火，(这在西医是泌尿系感染)，小肠火则是心火下移所致。
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