大豆种子是由子叶、胚组成的，胚包括胚芽和胚根。两者的区别很明显，胚芽在胚的上部，呈尖尖状，胚根在胚的下部，呈半球状。
种子大豆的种子由种皮、子叶和胚组成。种皮由珠被发育而成，对种子起保护作用。种皮外侧有明显的脐，是种子脱离珠柄后留下的痕迹，脐的大小，颜色是区别品种的主要性状。脐的上部有一个凹陷的小点，称为合点，脐的下端有一小孔，是胚珠的珠孔，种子发芽时胚根就从珠孔伸出。
菜豆种子的形态结构：按观察菜豆种子的解剖方法，取一粒已浸泡好的菜豆种子进行观察，在种子一端黑色疤痕为种脐，其结构和菜豆种子基本相同，但种脐上无瘤状突起，胚芽上的幼叶无菜豆清楚。
植物的胚芽是植物种子的胚之组成部分之一，与胚轴相连。
